41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3576 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3571  putative lipoprotein  98.9 
 
 		 363 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3576  putative lipoprotein  100 
 
 		 363 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3644  putative lipoprotein  98.9 
 
 		 363 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20040  hypothetical protein  30.58 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.544661  hitchhiker  0.00296219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3526  hypothetical protein  45.3 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2132  hypothetical protein  29.72 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136142  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3160  putative lipoprotein  37.24 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3172  putative lipoprotein  37.24 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3222  putative lipoprotein  37.24 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3041  putative lipoprotein  33.19 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2437  hypothetical protein  31.68 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3485  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.57 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12168  lipoprotein lppL  34.17 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.605645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.51 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.85 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.56 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  22.99 
 
 		 1094 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.09 
 
 		 601 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.89 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.96 
 
 		 362 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1257  hypothetical protein  26.59 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  25.42 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.06 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  28.22 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  25.42 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2941  hypothetical protein  29.76 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1667 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.99 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.99 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.24 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.24 
 
 		 517 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  26.69 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1189 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  21.61 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.24 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.43 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.71 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>