13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20040  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  692    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.544661  hitchhiker  0.00296219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3526  hypothetical protein  46.04 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3041  putative lipoprotein  36.43 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12168  lipoprotein lppL  32.54 
 
 		 358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.605645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2132  hypothetical protein  42.38 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136142  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3160  putative lipoprotein  39.78 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3222  putative lipoprotein  39.78 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3172  putative lipoprotein  39.78 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3485  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.38 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2437  hypothetical protein  40.28 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3571  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3644  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3576  putative lipoprotein  30.47 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>