13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3485 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3485  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 
344 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3041  putative lipoprotein  72.59 
 
 
325 aa  422  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3160  putative lipoprotein  68.44 
 
 
343 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3222  putative lipoprotein  68.44 
 
 
343 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3172  putative lipoprotein  68.44 
 
 
343 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12168  lipoprotein lppL  58.31 
 
 
358 aa  358  6e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.605645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3526  hypothetical protein  37.35 
 
 
321 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2437  hypothetical protein  37.3 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2132  hypothetical protein  33.74 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136142  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20040  hypothetical protein  32.87 
 
 
354 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.544661  hitchhiker  0.00296219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3571  putative lipoprotein  29.88 
 
 
363 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3644  putative lipoprotein  29.88 
 
 
363 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3576  putative lipoprotein  29.57 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>