13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3222 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3160  putative lipoprotein  100 
 
 
343 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3222  putative lipoprotein  100 
 
 
343 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.249461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3172  putative lipoprotein  100 
 
 
343 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3485  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  65.8 
 
 
344 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3041  putative lipoprotein  66.87 
 
 
325 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.854673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12168  lipoprotein lppL  60.41 
 
 
358 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.605645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3526  hypothetical protein  38.81 
 
 
321 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2132  hypothetical protein  36.28 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.136142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2437  hypothetical protein  44.1 
 
 
322 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20040  hypothetical protein  39.78 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.544661  hitchhiker  0.00296219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3571  putative lipoprotein  37.93 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3644  putative lipoprotein  37.93 
 
 
363 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25524  normal  0.269261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3576  putative lipoprotein  36.91 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>