34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2848 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  634    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  88.2 
 
 
323 aa  528  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  80.56 
 
 
323 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  70 
 
 
318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  70 
 
 
318 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  57.05 
 
 
347 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  48.71 
 
 
357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  52 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  51.96 
 
 
319 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  44.41 
 
 
338 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  42.67 
 
 
314 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  45.21 
 
 
324 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  42.53 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  48.1 
 
 
292 aa  168  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  37.42 
 
 
309 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  38.49 
 
 
303 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  40.42 
 
 
254 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  34.18 
 
 
290 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  39.56 
 
 
276 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  34.47 
 
 
294 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  36.81 
 
 
398 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  30.92 
 
 
259 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  26.38 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  32.48 
 
 
1087 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  30.35 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  30.93 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
1071 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  28.19 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  31.16 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  26.87 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  26.16 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  27.88 
 
 
464 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  27.41 
 
 
465 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2942  hypothetical protein  26.92 
 
 
551 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>