33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3700 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  630  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  71.47 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  53.82 
 
 
324 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  53.55 
 
 
314 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  44.23 
 
 
347 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  46.06 
 
 
323 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  40 
 
 
357 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  43.51 
 
 
323 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  53.88 
 
 
292 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  49.14 
 
 
318 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  49.14 
 
 
318 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  42.12 
 
 
322 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  39.82 
 
 
319 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  46.58 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  39.21 
 
 
319 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  43.03 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  35.89 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  41.88 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  45.33 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  35.9 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  35.59 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  32.71 
 
 
1087 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  35.51 
 
 
1071 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  31.74 
 
 
259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  29.82 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  28.74 
 
 
294 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  31.64 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  30.29 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  30.29 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  28.43 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  28.5 
 
 
465 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>