23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4287 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  42.44 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  35.74 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  36.32 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  34.87 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  34.16 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  32.41 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  30.77 
 
 		 357 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  33.48 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  31.4 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  30.03 
 
 		 398 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  34.17 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  31.19 
 
 		 276 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  31.47 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  28.45 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  29.25 
 
 		 347 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  27.95 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  31.02 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  28.04 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  28.04 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  26.16 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  22.32 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>