34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2600 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  96.24 
 
 		 319 aa  585  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  49.56 
 
 		 357 aa  305  7e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  53.23 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  51.94 
 
 		 347 aa  275  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  51.38 
 
 		 323 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  52 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  60.68 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  60.68 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  44.41 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  41.82 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  40.62 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  39.06 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  47.46 
 
 		 292 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  31.58 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  35.53 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  36.84 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  39.38 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  43.13 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  43.3 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  38.05 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  26.77 
 
 		 307 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  30.41 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  31.4 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  32.86 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  32.23 
 
 		 1087 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  30.39 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  30.39 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  28.14 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  33.04 
 
 		 1071 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  27.98 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  28.5 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  29.96 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2942  hypothetical protein  25.13 
 
 		 551 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>