32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1678 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  100 
 
 		 398 aa  765    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  36.54 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  36.27 
 
 		 314 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  37.94 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  35.88 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  32.54 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  33 
 
 		 319 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  31.58 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  37.09 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  35.13 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  32.08 
 
 		 309 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  33.42 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  34.5 
 
 		 318 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  34.5 
 
 		 318 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  33.58 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  35.22 
 
 		 290 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  31.31 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  33.11 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  33.44 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  29.52 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  24.21 
 
 		 307 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  34.92 
 
 		 322 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  26.84 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  24.22 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  28.83 
 
 		 1087 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  27.11 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  34.34 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  27.04 
 
 		 465 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  48.28 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  32.5 
 
 		 1071 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  21.31 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2942  hypothetical protein  23.59 
 
 		 551 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>