34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4019 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  693    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  49.56 
 
 
319 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  47.88 
 
 
319 aa  291  8e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  49.18 
 
 
347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  57.03 
 
 
323 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  57.54 
 
 
322 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  57.31 
 
 
323 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  48.8 
 
 
318 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  48.8 
 
 
318 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  41.44 
 
 
314 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  37.67 
 
 
338 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  40 
 
 
322 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  37.95 
 
 
324 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  46.49 
 
 
292 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  32.54 
 
 
398 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  41.84 
 
 
290 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  39.76 
 
 
309 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  45.61 
 
 
254 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  41.98 
 
 
303 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  42.58 
 
 
276 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  35.71 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  33.49 
 
 
259 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  29.68 
 
 
315 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  25.32 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  29.72 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  29.72 
 
 
297 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  30.38 
 
 
294 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  34.53 
 
 
1087 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  29.52 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  35.32 
 
 
1071 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  30.59 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  29.49 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  27.27 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2942  hypothetical protein  25.94 
 
 
551 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>