33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2775 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  908    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  80.78 
 
 		 465 aa  669    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  31.16 
 
 		 1087 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  33.77 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  28.09 
 
 		 294 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  30.48 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  31.9 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  28.27 
 
 		 1071 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  32.74 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  32.24 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  29.54 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  30.59 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  29.17 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  27.27 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  27.98 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  28.64 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  31.43 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  28.24 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  26.92 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  26.56 
 
 		 254 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6153  hypothetical protein  21.85 
 
 		 563 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  27.88 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  27.88 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  27.23 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  27.1 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  28.23 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  29.08 
 
 		 276 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  27.8 
 
 		 320 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  26.25 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  25.96 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>