34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5746 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  100 
 
 		 314 aa  617  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  52.32 
 
 		 338 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  53.23 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  49.09 
 
 		 324 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  44.62 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  44.41 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  43.75 
 
 		 323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  41.44 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  41.72 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  44.08 
 
 		 323 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  42.67 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  51.89 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  41.75 
 
 		 318 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  41.75 
 
 		 318 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  38.61 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  43.72 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  47.3 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  40.6 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  44.64 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  35.84 
 
 		 398 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  36.14 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  36.02 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  29.95 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  30.17 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  32.99 
 
 		 259 aa  95.9  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  33.49 
 
 		 1087 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  34.98 
 
 		 1071 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  29.59 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  29.59 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  29.17 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  29.9 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  28.95 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  25.85 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2942  hypothetical protein  28.79 
 
 		 551 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>