33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2470 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  43.33 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  41.88 
 
 
322 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  45.06 
 
 
294 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  41.84 
 
 
357 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  40.6 
 
 
314 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  40.85 
 
 
338 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  42.44 
 
 
315 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  40.85 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  39.08 
 
 
319 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  39.38 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  37.39 
 
 
309 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  37.97 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  38.17 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  37.39 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  33.96 
 
 
398 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  34.18 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  34.98 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  37.19 
 
 
318 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  37.19 
 
 
318 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  34.31 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  34.42 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  28.64 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  30.48 
 
 
464 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  29.81 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  27.62 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  26.76 
 
 
465 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  29.13 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  24.54 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  28 
 
 
1087 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  29.21 
 
 
1071 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  28.02 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>