33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0782 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0782  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.448011  hitchhiker  0.00577848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4551  hypothetical protein  59.18 
 
 		 323 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0911  hypothetical protein  57.1 
 
 		 323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2848  hypothetical protein  57.74 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.204665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4019  hypothetical protein  49.33 
 
 		 357 aa  298  9e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.428309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1451  hypothetical protein  56.35 
 
 		 318 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1469  hypothetical protein  56.35 
 
 		 318 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2600  hypothetical protein  52.12 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4239  hypothetical protein  50.15 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0019  hypothetical protein  45.64 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5746  secreted protein  42.01 
 
 		 314 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3700  hypothetical protein  45.3 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  0.0360952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1740  hypothetical protein  47.34 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.393164  decreased coverage  0.00278039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3604  hypothetical protein  51.9 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0468  hypothetical protein  41.12 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3046  hypothetical protein  43.05 
 
 		 254 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162929  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1678  secreted protein  31.62 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5883  hypothetical protein  38.4 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2470  hypothetical protein  37.97 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1916  hypothetical protein  40.81 
 
 		 276 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1613  hypothetical protein  36.71 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.226824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2231  hypothetical protein  27.51 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  35.09 
 
 		 1087 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0183  hypothetical protein  28.96 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0494  hypothetical protein  32.58 
 
 		 259 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1396  hypothetical protein  28.7 
 
 		 286 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1597  hypothetical protein  28.7 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2367  hypothetical protein  29.86 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4287  hypothetical protein  29.25 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0698926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2775  hypothetical protein  32.74 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2078  hypothetical protein  26.32 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  0.289101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  33.48 
 
 		 1071 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2400  hypothetical protein  30.97 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>