88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0117 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0117  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  100 
 
 
302 aa  620  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2145  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  62.5 
 
 
300 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2578  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  62.75 
 
 
300 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0152  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  55.78 
 
 
304 aa  345  4e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0411092  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2444  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  55.44 
 
 
297 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1438  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  48.12 
 
 
295 aa  276  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1631  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  46.2 
 
 
309 aa  269  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1411  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  43.73 
 
 
306 aa  265  8e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000298304  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2144  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  44 
 
 
300 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1392  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.02 
 
 
312 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1234  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.7 
 
 
309 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0548899  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0506  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.7 
 
 
309 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1402  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.38 
 
 
309 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0613  LPPG domain protein containing protein  39.62 
 
 
330 aa  231  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.586324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2334  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  43.69 
 
 
344 aa  227  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0613926  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1894  LPPG domain protein containing protein  41.42 
 
 
330 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0626  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.99 
 
 
319 aa  224  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2581  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.17 
 
 
330 aa  223  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.358929  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0762  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.39 
 
 
330 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0819  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.83 
 
 
326 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1138  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36.31 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0958  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.55 
 
 
311 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0582227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3979  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  38.43 
 
 
314 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0512735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0665  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36.77 
 
 
308 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000538735  hitchhiker  0.00000304665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1864  LPPG domain protein containing protein  35.16 
 
 
317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4047  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.99 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4072  LPPG domain protein containing protein  36.74 
 
 
314 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0749  LPPG domain-containing protein containing protein  38.52 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.478762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1380  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.35 
 
 
326 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2517  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.33 
 
 
353 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3767  LPPG domain protein containing protein  37.46 
 
 
329 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5868  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36.29 
 
 
360 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0383675  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0741  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.68 
 
 
321 aa  169  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0414  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.42 
 
 
307 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0742  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.52 
 
 
345 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.5344  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3009  LPPG domain protein containing protein  34.08 
 
 
313 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3851  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.71 
 
 
337 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1733  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.18 
 
 
359 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24050  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.57 
 
 
352 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06240  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.89 
 
 
322 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6333  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.26 
 
 
321 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0973292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4730  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.85 
 
 
359 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35626  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1360  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.6 
 
 
331 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0953961  normal  0.160978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1341  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.6 
 
 
331 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.760693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1324  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.6 
 
 
331 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.96739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7611  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.84 
 
 
330 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0455  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  38.1 
 
 
390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151633  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0060  LPPG domain protein containing protein  35.98 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4407  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.66 
 
 
329 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4175  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.91 
 
 
338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00401549  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1410  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.14 
 
 
337 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1183  LPPG domain protein containing protein  31.39 
 
 
335 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0886  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.57 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0129312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4253  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.06 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487733  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4304  LPPG domain protein containing protein  31.8 
 
 
319 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.957134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0944  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.8 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4149  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.67 
 
 
324 aa  138  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3302  LPPG domain protein containing protein  32.06 
 
 
362 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13290  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.89 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.970399 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1116  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.77 
 
 
317 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.45 
 
 
437 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  29.86 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.39 
 
 
428 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  26.13 
 
 
396 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.44 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.56 
 
 
325 aa  48.9  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.24 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  27.35 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  26.27 
 
 
339 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  27.88 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.66 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.33 
 
 
457 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.38 
 
 
326 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.76 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.64 
 
 
438 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.27 
 
 
458 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.77 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.27 
 
 
458 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.09 
 
 
388 aa  43.5  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  25.33 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.82 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.6 
 
 
350 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.74 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  23.98 
 
 
439 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  27.65 
 
 
458 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  23.11 
 
 
322 aa  42.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  28.02 
 
 
314 aa  42.4  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  26.15 
 
 
328 aa  42.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>