60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4304 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4304  LPPG domain protein containing protein  100 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.957134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6333  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  72.64 
 
 		 321 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0973292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06240  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  66.46 
 
 		 322 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0944  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  66.25 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4730  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  66.67 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0886  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  65.71 
 
 		 315 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0129312 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1324  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  61.83 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.96739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1341  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  61.83 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.760693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0742  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  61.58 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.5344  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1360  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  61.51 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0953961  normal  0.160978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4072  LPPG domain protein containing protein  63.17 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1733  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  64.83 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2517  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  62.65 
 
 		 353 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0749  LPPG domain-containing protein containing protein  66.56 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.478762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3302  LPPG domain protein containing protein  59.06 
 
 		 362 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1183  LPPG domain protein containing protein  58.81 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5868  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  56.08 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0383675  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7611  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  62.62 
 
 		 330 aa  363  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13290  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  56.84 
 
 		 331 aa  362  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.970399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4175  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  57.74 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00401549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1380  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  61.06 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3767  LPPG domain protein containing protein  62.58 
 
 		 329 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1410  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  63.01 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3851  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  58.65 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24050  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  55.39 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0455  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  62.55 
 
 		 390 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1138  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  45.74 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3979  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  45.54 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0512735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0958  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  47 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0582227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3009  LPPG domain protein containing protein  50.19 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0665  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.66 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000538735  hitchhiker  0.00000304665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1864  LPPG domain protein containing protein  39.16 
 
 		 317 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0626  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.97 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0414  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.91 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0060  LPPG domain protein containing protein  43.09 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4253  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.46 
 
 		 334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4407  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.14 
 
 		 329 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4047  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.69 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1411  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.55 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000298304  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0741  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  41.29 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1631  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.48 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0613  LPPG domain protein containing protein  35.46 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.586324  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2444  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.04 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1116  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36.34 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1234  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  26.75 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0548899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0819  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  26.77 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1392  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  25.64 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0152  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.99 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0411092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2334  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.71 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0613926  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0506  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  26.11 
 
 		 309 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1402  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  26.43 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1894  LPPG domain protein containing protein  31.1 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1438  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.23 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2578  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.33 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2145  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.27 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0117  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.8 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4149  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.76 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2581  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.02 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.358929  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0762  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.66 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2144  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.71 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>