109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0060 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0060  LPPG domain protein containing protein  100 
 
 
326 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0958  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  49.85 
 
 
311 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0582227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1864  LPPG domain protein containing protein  44.85 
 
 
317 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0414  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  46.48 
 
 
307 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3009  LPPG domain protein containing protein  47.4 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4253  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  41.23 
 
 
334 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487733  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1138  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.51 
 
 
314 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4072  LPPG domain protein containing protein  44.58 
 
 
314 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3979  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  43.53 
 
 
314 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0512735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0665  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  43.69 
 
 
308 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000538735  hitchhiker  0.00000304665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4407  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  44.21 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2517  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.68 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1380  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  45.7 
 
 
326 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0749  LPPG domain-containing protein containing protein  46.74 
 
 
327 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.478762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3851  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  46.31 
 
 
337 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3767  LPPG domain protein containing protein  45.31 
 
 
329 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06240  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.72 
 
 
322 aa  203  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4304  LPPG domain protein containing protein  45.02 
 
 
319 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.957134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0742  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  41.6 
 
 
345 aa  202  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.5344  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4047  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36.42 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5868  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  45.32 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0383675  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0944  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.94 
 
 
318 aa  199  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1733  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.43 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0626  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.54 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0741  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  44.84 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4175  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.06 
 
 
338 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00401549  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1324  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.38 
 
 
331 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.96739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1341  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.38 
 
 
331 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.760693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0886  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  43.62 
 
 
315 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0129312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1360  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.06 
 
 
331 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0953961  normal  0.160978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0455  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  43.93 
 
 
390 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1410  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.95 
 
 
337 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3302  LPPG domain protein containing protein  39.12 
 
 
362 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4730  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  38.17 
 
 
359 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6333  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.06 
 
 
321 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0973292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24050  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.56 
 
 
352 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7611  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  44.25 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13290  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.94 
 
 
331 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.970399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4149  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.24 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2444  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.76 
 
 
297 aa  179  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1116  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.51 
 
 
317 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1183  LPPG domain protein containing protein  38.51 
 
 
335 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2578  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.37 
 
 
300 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1438  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  38.49 
 
 
295 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0506  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  29.14 
 
 
309 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1402  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  29.45 
 
 
309 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1392  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  28.22 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0117  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.54 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0613  LPPG domain protein containing protein  33.14 
 
 
330 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.586324  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1234  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  28.83 
 
 
309 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0548899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2145  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.69 
 
 
300 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1894  LPPG domain protein containing protein  33.53 
 
 
330 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0819  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  28.7 
 
 
326 aa  153  5e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1411  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  30.75 
 
 
306 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000298304  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0152  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.39 
 
 
304 aa  149  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0411092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1631  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.6 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2581  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.01 
 
 
330 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.358929  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2334  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.31 
 
 
344 aa  126  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0613926  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0762  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  30.23 
 
 
330 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2144  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.86 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.16 
 
 
434 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  27.08 
 
 
439 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.25 
 
 
463 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.14 
 
 
358 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.05 
 
 
438 aa  52.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  27.08 
 
 
331 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  27.08 
 
 
331 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.82 
 
 
458 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.82 
 
 
458 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.2 
 
 
457 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  27.74 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  26.12 
 
 
457 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9154  hypothetical protein  42.19 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.63 
 
 
443 aa  49.7  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.1 
 
 
453 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.75 
 
 
311 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0864  hypothetical protein  30.22 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0895  hypothetical protein  30.22 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1403  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.34 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0067064  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.69 
 
 
428 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.21 
 
 
442 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.81 
 
 
375 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0927  hypothetical protein  29.5 
 
 
302 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0950  hypothetical protein  29.5 
 
 
302 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0836  hypothetical protein  29.5 
 
 
302 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  43.14 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  25.57 
 
 
461 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  26.69 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0803  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000436595  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.53 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  24.79 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  27.07 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.07 
 
 
324 aa  45.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00747  predicted transferase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  31.93 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2862  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.93 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000990783  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  23.81 
 
 
461 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0834  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0843  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00101345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2863  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.93 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000381637  normal  0.0132805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2572  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000058678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>