71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1116 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1116  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  100 
 
 		 317 aa  618  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4047  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  55.12 
 
 		 323 aa  340  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0958  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  49.51 
 
 		 311 aa  271  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0582227  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4253  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  50.18 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0665  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  45.58 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000538735  hitchhiker  0.00000304665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0414  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  47.23 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1864  LPPG domain protein containing protein  42.17 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3009  LPPG domain protein containing protein  45.57 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3979  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  46.98 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0512735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1138  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.77 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4407  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.21 
 
 		 329 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0741  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.31 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0626  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.77 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1380  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.19 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4072  LPPG domain protein containing protein  38.41 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7611  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  41.44 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1411  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.44 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000298304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2444  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.78 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0060  LPPG domain protein containing protein  39.74 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4149  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.24 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0742  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.86 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.5344  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0749  LPPG domain-containing protein containing protein  39.32 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.478762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4304  LPPG domain protein containing protein  37.38 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.957134  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0944  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4175  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.83 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00401549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5868  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  38.17 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0383675  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1410  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.82 
 
 		 337 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1392  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  29.26 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3851  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.5 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1631  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.33 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0506  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  28.94 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0455  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.52 
 
 		 390 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0886  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  38.26 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0129312 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1402  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  29.26 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3767  LPPG domain protein containing protein  36.17 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2145  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36.4 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0613  LPPG domain protein containing protein  33.55 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.586324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2517  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.56 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620741  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2578  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.41 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1234  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  29.26 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0548899  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1894  LPPG domain protein containing protein  33.89 
 
 		 330 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6333  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.15 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0973292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06240  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.75 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1438  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.32 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0152  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.97 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0411092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13290  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.76 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.970399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24050  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.04 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0117  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.2 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2581  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.35 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.358929  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1183  LPPG domain protein containing protein  32.91 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1733  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.42 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1324  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.89 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.96739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1341  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.89 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.760693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1360  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.53 
 
 		 331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0953961  normal  0.160978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3302  LPPG domain protein containing protein  33.77 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4730  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.99 
 
 		 359 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2334  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.33 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0613926  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0819  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  25.78 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0762  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.67 
 
 		 330 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2144  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  30.94 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  31.01 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  25.76 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  25.76 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  20.45 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.95 
 
 		 437 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.65 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.51 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  39.62 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  35.64 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  27.09 
 
 		 451 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>