93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0944 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0944  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  100 
 
 
318 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0886  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  87.58 
 
 
315 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0129312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4304  LPPG domain protein containing protein  66.89 
 
 
319 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.957134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0749  LPPG domain-containing protein containing protein  65.22 
 
 
327 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.478762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6333  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  61.18 
 
 
321 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0973292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2517  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  60.99 
 
 
353 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06240  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  59.75 
 
 
322 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1733  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  60.7 
 
 
359 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3302  LPPG domain protein containing protein  58.65 
 
 
362 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1360  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  60.13 
 
 
331 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0953961  normal  0.160978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1324  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  59.81 
 
 
331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.96739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1341  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  59.81 
 
 
331 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.760693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0742  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  58.82 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.5344  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4730  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  57.51 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35626  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4175  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  57.36 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00401549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4072  LPPG domain protein containing protein  59.62 
 
 
314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1380  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  59.67 
 
 
326 aa  352  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0867946  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5868  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  54.44 
 
 
360 aa  345  8e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0383675  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1183  LPPG domain protein containing protein  54.95 
 
 
335 aa  344  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13290  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  54.74 
 
 
331 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.970399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3767  LPPG domain protein containing protein  60.52 
 
 
329 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3851  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  54.78 
 
 
337 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7611  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  56.04 
 
 
330 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1410  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  57.37 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0455  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  62.27 
 
 
390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151633  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24050  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  51.86 
 
 
352 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1138  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  43.62 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0428431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3979  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  45.04 
 
 
314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0512735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0958  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  46.64 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0582227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3009  LPPG domain protein containing protein  46.79 
 
 
313 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0626  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.79 
 
 
319 aa  205  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0665  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.86 
 
 
308 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000538735  hitchhiker  0.00000304665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4253  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  42.2 
 
 
334 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487733  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1864  LPPG domain protein containing protein  40.66 
 
 
317 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0414  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40 
 
 
307 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4047  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  37.23 
 
 
323 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0741  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  39.34 
 
 
321 aa  185  8e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4407  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  40.82 
 
 
329 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0060  LPPG domain protein containing protein  42.42 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1631  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.18 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1116  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36 
 
 
317 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1392  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  27.74 
 
 
312 aa  149  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4149  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.99 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2145  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  36.88 
 
 
300 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.347736  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1234  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  25.82 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0548899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2444  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  30.8 
 
 
297 aa  145  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0819  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  27.88 
 
 
326 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1438  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  35.36 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0506  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  26.28 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2578  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  32.27 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.681719 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1402  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  26.64 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0613  LPPG domain protein containing protein  34.48 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.586324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0117  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  31.8 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2581  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  33.84 
 
 
330 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.358929  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1411  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  30.27 
 
 
306 aa  135  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000298304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1894  LPPG domain protein containing protein  30.75 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2334  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  34.36 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0613926  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0152  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  30.29 
 
 
304 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0411092  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0762  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  29.13 
 
 
330 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2144  LPPG:FO 2-phospho-L-lactate transferase  30.04 
 
 
300 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  29.66 
 
 
316 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.2 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.06 
 
 
437 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  26.03 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  26.03 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.71 
 
 
434 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.59 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.05 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  28.28 
 
 
457 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.74 
 
 
438 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.49 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.97 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  26.48 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  24.6 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  25.79 
 
 
317 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.87 
 
 
457 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  26.19 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  26.19 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  24.19 
 
 
439 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  23.66 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.19 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.29 
 
 
442 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  33.03 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  26.67 
 
 
461 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  24.02 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  25.7 
 
 
461 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  25.5 
 
 
461 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  21.83 
 
 
328 aa  42.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>