260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01750 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01750  Acyl dehydratase  100 
 
 
153 aa  317  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1690  MaoC-like dehydratase  51.77 
 
 
148 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  43.36 
 
 
158 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0968  nodulation protein N, putative  43.36 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0773042  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0908  putative nodulation protein N  43.36 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  46.56 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  42.34 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  42.34 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  41.01 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  49.55 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3008  dehydratase  39.57 
 
 
228 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026488  normal  0.774607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  40.91 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  40.71 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  42.86 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1105  nodulation protein N  41.13 
 
 
159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  40.97 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  39.86 
 
 
151 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 
154 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  40 
 
 
152 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  39.04 
 
 
151 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  45.92 
 
 
158 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  39.31 
 
 
156 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2877  MaoC domain protein dehydratase  37.5 
 
 
153 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  40.56 
 
 
156 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  39.16 
 
 
151 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
151 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  39.16 
 
 
153 aa  104  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  37.78 
 
 
150 aa  104  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  40.26 
 
 
151 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2797  MaoC-like dehydratase  38.93 
 
 
163 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  38.46 
 
 
151 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 
150 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  45.92 
 
 
158 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
151 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  40.58 
 
 
166 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  35.86 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  40.98 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  41.75 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  39.81 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  37.01 
 
 
162 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  36.3 
 
 
158 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  39.81 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  37.31 
 
 
150 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  36.15 
 
 
160 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  38.35 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  44.79 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  36.92 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  38.06 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  36.15 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  36.15 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  36.15 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  36.15 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  36.15 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  36.15 
 
 
160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  36.72 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  36.11 
 
 
152 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  38.89 
 
 
159 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  41.09 
 
 
160 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  36.5 
 
 
155 aa  96.7  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1362  MaoC domain protein dehydratase  36.72 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  36.92 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  35.71 
 
 
152 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  43.81 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  39.29 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1788  MaoC domain-containing protein  45.45 
 
 
228 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  36.57 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  39.81 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  34.53 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05460  oxidoreductase  36.88 
 
 
226 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  37.86 
 
 
158 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  37.86 
 
 
158 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  37.86 
 
 
158 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
163 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  38.46 
 
 
148 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  38.83 
 
 
158 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2065  dehydratase  36.17 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  45.63 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  45.63 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  45.63 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  41.24 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2554  MaoC-like dehydratase  35.04 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  38.97 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  37.6 
 
 
151 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  44.25 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2724  Enoyl-CoA hydratase  43.33 
 
 
160 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0179226  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  35.53 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  37.96 
 
 
152 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  36.76 
 
 
153 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001520  acyl dehydratase  36.67 
 
 
226 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000377103  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  39.26 
 
 
161 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0292  Enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 
162 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000103389  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  36.62 
 
 
154 aa  91.3  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>