292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2042 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  330  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  85.19 
 
 
159 aa  280  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  83.33 
 
 
159 aa  275  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  74.07 
 
 
157 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  71.43 
 
 
158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  61.25 
 
 
156 aa  198  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  61.49 
 
 
151 aa  193  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  58.39 
 
 
151 aa  192  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  57.76 
 
 
194 aa  189  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  56.88 
 
 
155 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  57.41 
 
 
164 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  55.28 
 
 
154 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  55.28 
 
 
154 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  56.52 
 
 
151 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  54.43 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  54.04 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  50.93 
 
 
151 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  56.77 
 
 
158 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
153 aa  168  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  53.8 
 
 
158 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  55.28 
 
 
158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  53.46 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  52.8 
 
 
160 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  51.23 
 
 
150 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  53.42 
 
 
158 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  52.8 
 
 
160 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  52.8 
 
 
160 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  52.8 
 
 
160 aa  158  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  52.8 
 
 
160 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  47.13 
 
 
152 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  52.8 
 
 
160 aa  158  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  54.67 
 
 
148 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  53.42 
 
 
158 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  52.8 
 
 
160 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  53.42 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  53.42 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  53.42 
 
 
158 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  46.2 
 
 
156 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  47.13 
 
 
152 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  51.23 
 
 
160 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  47.17 
 
 
150 aa  153  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  43.83 
 
 
151 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  48.43 
 
 
152 aa  152  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  51.55 
 
 
158 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  49.37 
 
 
153 aa  150  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  47.77 
 
 
153 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  50.93 
 
 
152 aa  149  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  48.73 
 
 
150 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  48.7 
 
 
158 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  46.15 
 
 
151 aa  147  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  47.2 
 
 
151 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  47.13 
 
 
150 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  44.03 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  47.17 
 
 
151 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  49.32 
 
 
150 aa  144  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  48.1 
 
 
152 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  49.68 
 
 
152 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  46.25 
 
 
151 aa  141  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  46.1 
 
 
158 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1606  MaoC domain protein dehydratase  47.13 
 
 
153 aa  140  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00168031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3008  dehydratase  43.56 
 
 
228 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026488  normal  0.774607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  49.36 
 
 
153 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4112  Enoyl-CoA hydratase  42.5 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0069293  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  44.3 
 
 
151 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  46.84 
 
 
150 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  43.48 
 
 
151 aa  137  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  44.1 
 
 
155 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1788  MaoC domain-containing protein  43.48 
 
 
228 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  43.4 
 
 
150 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  43.75 
 
 
162 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  43.4 
 
 
150 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  43.4 
 
 
150 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  46.36 
 
 
151 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  43.87 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  44.08 
 
 
154 aa  130  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  45.7 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  46.48 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  48 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  42.77 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  45.75 
 
 
151 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  46.67 
 
 
151 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  47.33 
 
 
151 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  46 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  44.65 
 
 
151 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  44.83 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  44.52 
 
 
154 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0652  MaoC domain protein dehydratase  46.41 
 
 
158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  44.67 
 
 
151 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  44.03 
 
 
162 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0497  hypothetical protein  42.41 
 
 
226 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.628892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  42.41 
 
 
155 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  46 
 
 
151 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4410  dehydratase  39.62 
 
 
157 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  45.33 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  41.88 
 
 
158 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  40.13 
 
 
160 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  40.26 
 
 
157 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  43.95 
 
 
154 aa  120  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  45.51 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>