More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4397 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  77.18 
 
 		 151 aa  254  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  74.5 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  76.67 
 
 		 155 aa  248  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  73.15 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  68.46 
 
 		 164 aa  229  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  69.8 
 
 		 194 aa  222  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  67.11 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  67.11 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  63.87 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  61.25 
 
 		 162 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  63.06 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  59.87 
 
 		 159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  58.39 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  59.24 
 
 		 159 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  58.39 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  58.5 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  57.05 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  59.74 
 
 		 152 aa  173  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  53.69 
 
 		 158 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  56.34 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 		 152 aa  167  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  59.42 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  53.69 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  55.78 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  52.94 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  53.42 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  52.03 
 
 		 151 aa  160  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  56.12 
 
 		 150 aa  160  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  53.74 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  53.74 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  49.66 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  53.42 
 
 		 151 aa  157  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1606  MaoC domain protein dehydratase  53.74 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00168031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  51.02 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  53.42 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  52.38 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  47.62 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  51.63 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  51.7 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  55.56 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  45.95 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  55.56 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  55.56 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  55.56 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  55.56 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  51.01 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  51.9 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  55.56 
 
 		 160 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  55.56 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  51.7 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  47.71 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  50.63 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  51.27 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  51.27 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  51.27 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  48.97 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  49.33 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  53.47 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  48.3 
 
 		 152 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  51.03 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  53.79 
 
 		 152 aa  146  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  50.68 
 
 		 151 aa  146  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  53.38 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  52.35 
 
 		 153 aa  143  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  49.03 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  48.73 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  48.1 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  51.33 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  50.7 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  45.33 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  45.89 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  45.39 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  49.32 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3764  dehydratase  44.9 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.51064  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3008  dehydratase  45.21 
 
 		 228 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026488  normal  0.774607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2724  Enoyl-CoA hydratase  47.26 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0179226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  48.61 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  48.61 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  47.14 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  47.14 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  48.94 
 
 		 166 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  45.65 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1105  nodulation protein N  48.59 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4410  dehydratase  42.36 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  48.94 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  49.3 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  48.92 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  46.81 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  48.94 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  45.14 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  45.14 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0497  hypothetical protein  43.95 
 
 		 226 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.628892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  48.55 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  46.43 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  47.48 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1788  MaoC domain-containing protein  45.03 
 
 		 228 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2065  dehydratase  45.65 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>