181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001520 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001520  acyl dehydratase  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000377103  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05460  oxidoreductase  89.82 
 
 
226 aa  428  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0426  MaoC domain-containing protein  72.12 
 
 
230 aa  332  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000106685  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0497  hypothetical protein  58.85 
 
 
226 aa  282  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.628892  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3008  dehydratase  52.63 
 
 
228 aa  248  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026488  normal  0.774607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1788  MaoC domain-containing protein  44.54 
 
 
228 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  48.7 
 
 
158 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2445  acyl dehydratase  47.55 
 
 
230 aa  148  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743728  normal  0.288751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  48.05 
 
 
158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  44.14 
 
 
151 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  39.74 
 
 
154 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  39.74 
 
 
154 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  42.28 
 
 
151 aa  118  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  42.47 
 
 
153 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  38.93 
 
 
152 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  41.94 
 
 
162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0652  MaoC domain protein dehydratase  42.21 
 
 
158 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  39.87 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  37.58 
 
 
152 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  42.45 
 
 
150 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  39.86 
 
 
151 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  35.62 
 
 
162 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  39.04 
 
 
150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  39.04 
 
 
150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  42.75 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  41.06 
 
 
160 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  39.04 
 
 
150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 
151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  41.78 
 
 
150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  40.13 
 
 
156 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  40.14 
 
 
155 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  43.36 
 
 
150 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  45.14 
 
 
151 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  40.4 
 
 
160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  40.4 
 
 
160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  41.5 
 
 
153 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  40.4 
 
 
160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  40.4 
 
 
160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  40.4 
 
 
160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  41.13 
 
 
152 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  41.06 
 
 
159 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  42.47 
 
 
152 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
152 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  41.56 
 
 
151 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  36.84 
 
 
150 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  42.28 
 
 
157 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  38.51 
 
 
153 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  40.14 
 
 
164 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  39.31 
 
 
150 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  40.13 
 
 
159 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
150 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  41.06 
 
 
151 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  39.86 
 
 
150 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  35.29 
 
 
151 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  40.4 
 
 
160 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  39.74 
 
 
160 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
151 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  44.03 
 
 
155 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  43.57 
 
 
151 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  38.62 
 
 
160 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  36.84 
 
 
168 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  41.18 
 
 
162 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  43.06 
 
 
151 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  38.51 
 
 
151 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  39.46 
 
 
148 aa  104  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  44.2 
 
 
151 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  38.67 
 
 
158 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
153 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  42.36 
 
 
151 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  43.24 
 
 
150 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  39.74 
 
 
158 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  41.61 
 
 
157 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2554  MaoC-like dehydratase  41.26 
 
 
159 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  43.26 
 
 
151 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  38.93 
 
 
155 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  40.15 
 
 
151 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  42.14 
 
 
151 aa  101  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 
156 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  41.73 
 
 
151 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  38.93 
 
 
158 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 
151 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  36.75 
 
 
166 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  38.1 
 
 
152 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  38.82 
 
 
158 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1690  MaoC-like dehydratase  36.55 
 
 
148 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  38.82 
 
 
158 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  38.1 
 
 
158 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  38.82 
 
 
158 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  39.26 
 
 
158 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  37.42 
 
 
158 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  38.04 
 
 
158 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  39.86 
 
 
151 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  40.88 
 
 
154 aa  99  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  38.99 
 
 
161 aa  98.6  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  37.75 
 
 
158 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  38.93 
 
 
154 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  42.14 
 
 
151 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  40.71 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  42.11 
 
 
160 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>