221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2554 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2554  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  75.32 
 
 
159 aa  257  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  76.67 
 
 
160 aa  246  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2155  MaoC-like dehydratase  82.39 
 
 
158 aa  245  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  76.67 
 
 
154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  76.51 
 
 
155 aa  240  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  71.97 
 
 
166 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  55.03 
 
 
162 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  55.33 
 
 
161 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  54.61 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  53.69 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  54.36 
 
 
166 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  51.33 
 
 
162 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3765  nodulation protein N  50.33 
 
 
162 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  53.42 
 
 
158 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0968  nodulation protein N, putative  53.42 
 
 
158 aa  157  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0773042  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0908  putative nodulation protein N  53.42 
 
 
158 aa  157  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  52.17 
 
 
152 aa  156  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1105  nodulation protein N  52.35 
 
 
159 aa  153  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2797  MaoC-like dehydratase  53.42 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  46.31 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  48 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  50 
 
 
178 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  46.98 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  45.33 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  46 
 
 
151 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  44.67 
 
 
151 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  48.25 
 
 
152 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  46.21 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  46.67 
 
 
151 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  45.33 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  44 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  45.33 
 
 
151 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  45.89 
 
 
152 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  44 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  44 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  49.61 
 
 
154 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  45.03 
 
 
158 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0497  hypothetical protein  47.26 
 
 
226 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.628892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  44.59 
 
 
153 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2065  dehydratase  43.07 
 
 
153 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  43.45 
 
 
151 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  46.48 
 
 
162 aa  120  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  44.67 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  42.67 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  44.74 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  44.67 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  44.67 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  39.49 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  48.34 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  41.56 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  42.47 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  42 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  45.33 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  45.33 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  45.33 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  45.33 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  45.33 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  45.33 
 
 
160 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  42.07 
 
 
153 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  44.9 
 
 
194 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  45.71 
 
 
164 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  45.33 
 
 
160 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  40.91 
 
 
159 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  46.32 
 
 
151 aa  117  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  44.3 
 
 
151 aa  117  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  45.39 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  45 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  45.39 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  43.36 
 
 
158 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  42.25 
 
 
151 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  44.74 
 
 
158 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  44.67 
 
 
160 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  44.3 
 
 
152 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  41.89 
 
 
158 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  44.74 
 
 
158 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  44.93 
 
 
150 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
156 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  43.57 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  42.57 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  44.83 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  43.24 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  45.77 
 
 
160 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  45.65 
 
 
158 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  42.96 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3008  dehydratase  41.67 
 
 
228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026488  normal  0.774607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  44.9 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5146  putative oxidoreductase NodN-like protein  40.56 
 
 
152 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.511512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  42.36 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  44.22 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  53.85 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
151 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  40.97 
 
 
150 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  42.18 
 
 
151 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  41.43 
 
 
155 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0652  MaoC domain protein dehydratase  40.79 
 
 
158 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  41.67 
 
 
150 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>