208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1690 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1690  MaoC-like dehydratase  100 
 
 
148 aa  308  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01750  Acyl dehydratase  51.77 
 
 
153 aa  158  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  46.97 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  46.72 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  42.34 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  46.21 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  45.26 
 
 
151 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  44.53 
 
 
151 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  47.79 
 
 
162 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3967  Enoyl-CoA hydratase  42.65 
 
 
150 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  44.76 
 
 
151 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
152 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  43.07 
 
 
151 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  44.62 
 
 
151 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  43.36 
 
 
154 aa  120  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  43.8 
 
 
150 aa  120  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  44.03 
 
 
155 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  45.26 
 
 
151 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  41.84 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  44.7 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  40.97 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  39.01 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  41.61 
 
 
151 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  45.31 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  39.86 
 
 
168 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  42.75 
 
 
152 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  37.24 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  42.45 
 
 
150 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  41.48 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  41.55 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  42.03 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  38.3 
 
 
152 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
151 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 
150 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  44.19 
 
 
158 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  39.13 
 
 
150 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  39.13 
 
 
150 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  39.13 
 
 
150 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  38.36 
 
 
159 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  36.36 
 
 
160 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  44.03 
 
 
153 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  42.75 
 
 
194 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  35.66 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  42.54 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  35.66 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  42.34 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  41.91 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  41.91 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  35.66 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  35.66 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  35.66 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  37.76 
 
 
158 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  42.54 
 
 
151 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  37.76 
 
 
158 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  37.76 
 
 
158 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  39.13 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  37.67 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  41.35 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  40.88 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  42.22 
 
 
164 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1362  MaoC domain protein dehydratase  40 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  40 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0968  nodulation protein N, putative  38.46 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0773042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  41.54 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  42.07 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  40.74 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0908  putative nodulation protein N  38.46 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  34.97 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  37.96 
 
 
158 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  37.76 
 
 
158 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  38.46 
 
 
158 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  38.3 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  39.86 
 
 
160 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  37.12 
 
 
158 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  50 
 
 
151 aa  106  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  36.36 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  37.86 
 
 
163 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2877  MaoC domain protein dehydratase  39.01 
 
 
153 aa  105  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.589476  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
153 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  37.68 
 
 
162 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  38.62 
 
 
166 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0652  MaoC domain protein dehydratase  41.67 
 
 
158 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2169  dehydratase  44.09 
 
 
161 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  39.29 
 
 
154 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3764  dehydratase  40.31 
 
 
152 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.51064  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0426  MaoC domain-containing protein  38.19 
 
 
230 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000106685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3765  nodulation protein N  40.31 
 
 
162 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  39.26 
 
 
151 aa  104  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  36.88 
 
 
152 aa  104  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
151 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  39.42 
 
 
152 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  40.85 
 
 
150 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  37.59 
 
 
159 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  38.41 
 
 
166 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  37.01 
 
 
158 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  35.92 
 
 
158 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  35.92 
 
 
162 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>