196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3765 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3765  nodulation protein N  100 
 
 		 162 aa  335  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  72.84 
 
 		 162 aa  263  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  75.62 
 
 		 161 aa  262  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  74.69 
 
 		 162 aa  259  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  65.61 
 
 		 163 aa  235  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  66.04 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2797  MaoC-like dehydratase  57.5 
 
 		 163 aa  177  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  57.72 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3583  nodN-like protein  57.82 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.234832 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1105  nodulation protein N  54.49 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1389  dehydratase  56.05 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3089  MaoC-like dehydratase  54.11 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.767095  normal  0.110769 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0968  nodulation protein N, putative  55.48 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0773042  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0908  putative nodulation protein N  55.48 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  50.65 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  53.52 
 
 		 166 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  53.19 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  55.94 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2554  MaoC-like dehydratase  50.33 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.98648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2155  MaoC-like dehydratase  50 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  48.3 
 
 		 178 aa  143  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2161  MaoC-like dehydratase  49.33 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0601335  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  47.79 
 
 		 154 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3180  MaoC-like dehydratase  49.03 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  47.86 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  47.45 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0620  Enoyl-CoA hydratase  48.2 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1048  dehydratase  47.69 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0232986  normal  0.177681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  45 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  44 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  46.43 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  49.25 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  49.23 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  49.23 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  47.01 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  45.21 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  49.23 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  49.23 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  49.23 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  46.92 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  46.92 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  46.92 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  47.06 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  42.55 
 
 		 151 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  42.57 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5557  MaoC-like dehydratase  44.62 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  45.39 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  42.55 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  47.69 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  45.26 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  42.86 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  46.45 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  42.25 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  44.29 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  40.71 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  42.25 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  42.54 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  44.03 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  47.18 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  40.71 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  44.37 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  50 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  46.92 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1751  MaoC-like dehydratase  43.92 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0260343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1798  dehydratase  43.92 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1732  dehydratase  43.92 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  42.54 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  42.14 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  41.84 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  40.43 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  43.36 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  43.8 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  43.57 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  43.57 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1970  dehydratase  42.57 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  40.43 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0497  hypothetical protein  40.97 
 
 		 226 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.628892  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  39.33 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  44.83 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  46.05 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  43.57 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  40.43 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  40 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5146  putative oxidoreductase NodN-like protein  39.46 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.511512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  44.08 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  43.97 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  50 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  38.67 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  45.26 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  42.14 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  45.45 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  37.33 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  41.29 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1444  MaoC-like dehydratase  44.76 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0821742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  42.86 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  37.91 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  40.15 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1571  MaoC-like dehydratase  43.57 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  39.39 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>