27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0807 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0807  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000393126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  31.75 
 
 		 436 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  30.16 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0134  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.93 
 
 		 293 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0962  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0340549  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 259 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 346 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0941  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.551097  normal  0.0671843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 78 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>