70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1126 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1126    100 
 
 		 3378 bp  6696    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2179    100 
 
 		 2775 bp  4058    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  decreased coverage  0.00000000127376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2394    100 
 
 		 2937 bp  4054    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 		 1323 bp  1626    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  79.92 
 
 		 1323 bp  190  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2136  transposase  100 
 
 		 969 bp  123  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2799  hypothetical protein  100 
 
 		 810 bp  121  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  92.11 
 
 		 1395 bp  103  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  93.85 
 
 		 1332 bp  97.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 3999 bp  93.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  90 
 
 		 1395 bp  83.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  87.84 
 
 		 1329 bp  75.8  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  90.32 
 
 		 1323 bp  75.8  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.33 
 
 		 1341 bp  75.8  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  87.67 
 
 		 1341 bp  73.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  88.52 
 
 		 1350 bp  65.9  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  90.57 
 
 		 1365 bp  65.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  89.29 
 
 		 1362 bp  63.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  88.33 
 
 		 1323 bp  63.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  84.09 
 
 		 1344 bp  63.9  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  93.02 
 
 		 1422 bp  61.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  82.24 
 
 		 1395 bp  61.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.14 
 
 		 1329 bp  61.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  82.24 
 
 		 1395 bp  61.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  94.74 
 
 		 1404 bp  60  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  94.74 
 
 		 1311 bp  60  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  82.98 
 
 		 1338 bp  60  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  94.74 
 
 		 1308 bp  60  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  94.74 
 
 		 1311 bp  60  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0282  nucleotide sugar dehydrogenase  91.3 
 
 		 1338 bp  60  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  88.68 
 
 		 1338 bp  58  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.68 
 
 		 1413 bp  58  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  88.68 
 
 		 1413 bp  58  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  88.68 
 
 		 1353 bp  58  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.68 
 
 		 1374 bp  58  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 843 bp  58  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88.68 
 
 		 1401 bp  58  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  91.11 
 
 		 1344 bp  58  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  96.88 
 
 		 1305 bp  56  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  96.88 
 
 		 1401 bp  56  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  87.5 
 
 		 1317 bp  56  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  87.5 
 
 		 1380 bp  56  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  89.36 
 
 		 1338 bp  54  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.44 
 
 		 1401 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  80.31 
 
 		 1323 bp  54  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  86.44 
 
 		 1404 bp  54  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.44 
 
 		 1401 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3190  nucleotide sugar dehydrogenase  86.44 
 
 		 1362 bp  54  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.44 
 
 		 1401 bp  54  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.44 
 
 		 1401 bp  54  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.44 
 
 		 1401 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.44 
 
 		 1401 bp  54  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  90.7 
 
 		 1449 bp  54  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  92.31 
 
 		 1314 bp  54  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  86.21 
 
 		 1347 bp  52  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  94.12 
 
 		 1329 bp  52  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3115  UDP-glucose 6-dehydrogenase  88 
 
 		 1380 bp  52  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.78 
 
 		 1404 bp  52  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  92.11 
 
 		 1305 bp  52  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.79 
 
 		 1401 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.79 
 
 		 1377 bp  50.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  83.12 
 
 		 1422 bp  50.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  90.24 
 
 		 1335 bp  50.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  96.55 
 
 		 1305 bp  50.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  86.79 
 
 		 1401 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.12 
 
 		 1422 bp  50.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  83.12 
 
 		 1422 bp  50.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  86.79 
 
 		 1401 bp  50.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  88.89 
 
 		 1413 bp  50.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  88.89 
 
 		 1365 bp  50.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.159514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>