130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0198 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  75 
 
 		 62 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  73.44 
 
 		 62 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  58.18 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  58.18 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  56.36 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  55.77 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  51.56 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  54.1 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  58.18 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  53.57 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  52.73 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  45.61 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  52.46 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0535  50S ribosomal protein L28  45.21 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  47.76 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4841  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000224524  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  47.76 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  41.38 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  38.18 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  39.66 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  39.66 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  44.19 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0179  ribosomal protein L28  58.82 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2556  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  34.55 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4008  50S ribosomal protein L28  40.3 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4054  50S ribosomal protein L28  40.3 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3927  50S ribosomal protein L28  40.3 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0253871  hitchhiker  0.00124431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  40.3 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4115  50S ribosomal protein L28  40.3 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4041  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  41.38 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001820  LSU ribosomal protein L28p  58.82 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00654  50S ribosomal protein L28  58.82 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03494  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0068  ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03446  hypothetical protein  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00212142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0102  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000949516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  37.93 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3846  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.05688e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4138  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0074  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000990162  hitchhiker  0.000000134659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3972  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000229702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4062  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000394805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5007  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000024574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0648  50S ribosomal protein L28P  40.98 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2425  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00488373  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  41.38 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2750  50S ribosomal protein L28  46.81 
 
 		 97 aa  42.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  32.73 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  34.62 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3565  50S ribosomal protein L28  55.88 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0150151  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  41.38 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  40.38 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  32.73 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3586  50S ribosomal protein L28  45.24 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18615 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  39.66 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3879  50S ribosomal protein L28  45.24 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3567  ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3274  ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0370278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  39.66 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1706  ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298702  normal  0.0538671 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0386  50S ribosomal protein L28  46.81 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  hitchhiker  0.000000115642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4560  50S ribosomal protein L28  46.81 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191213  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3302  50S ribosomal protein L28  41.46 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592148  normal  0.0516815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0222  50S ribosomal protein L28  51.28 
 
 		 94 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0327  ribosomal protein L28  55.88 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0383291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145  50S ribosomal protein L28  52.94 
 
 		 78 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00227555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3827  50S ribosomal protein L28  55.88 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.199336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>