46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0446 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 66 aa  134  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  90.91 
 
 		 66 aa  123  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  68.42 
 
 		 61 aa  84  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  59.65 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  51.52 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  56.45 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  54.1 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  54.1 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  52.24 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  52.24 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  50.94 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  47.76 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  48.21 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  35.09 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  47.17 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  42.11 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  41.51 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  36.21 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  40.38 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  39.62 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  40 
 
 		 63 aa  40  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 62 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>