189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0201 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 64 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  58.46 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  62.3 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  55.38 
 
 		 65 aa  68.2  0.00000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  56.06 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  46.55 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  54 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  52 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  45 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  49.09 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  46.97 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  53.66 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  43.94 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  42.42 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  44.62 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  44.62 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  37.88 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  44.62 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  43.28 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5282  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5333  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3565  50S ribosomal protein L28  39.39 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0150151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5192  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244386  normal  0.27276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  43.94 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4374  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.335186 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0179  ribosomal protein L28  40.58 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48050  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3180  50S ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  43.4 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 77 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4841  50S ribosomal protein L28  42.19 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000224524  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0089  ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0224  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5537  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0793752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2290  50S ribosomal protein L28P  44.07 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.798347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  47.73 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  42.42 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  41.54 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1468  ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255813  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  41.54 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  39.66 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  39.66 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2016  50S ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42169  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0726  50S ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140106  normal  0.323515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3114  50S ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.878513  hitchhiker  0.00268781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>