49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1506 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 66 aa  134  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  90.91 
 
 		 66 aa  123  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  77.19 
 
 		 61 aa  92  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  64.91 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  57.89 
 
 		 61 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 61 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  55.22 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  52.46 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  52.46 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  55.22 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  53.85 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  53.85 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  51.92 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  42.11 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  48.21 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  47.76 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  43.4 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  42.31 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  39.62 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 63 aa  42  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  41.51 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  36.21 
 
 		 65 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 62 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11200  LSU ribosomal protein L28P  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00741345  normal  0.589072 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  42.22 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1987  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 63 aa  40  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1705  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1024  ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 73 aa  40  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>