123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0488 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  86.15 
 
 		 66 aa  114  5e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  62.3 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  60 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  55.56 
 
 		 63 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  62.71 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  59.32 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  59.32 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  52.46 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  51.67 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  50.82 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3274  ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0370278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  42.19 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  50.91 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  47.17 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  49.06 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  46.43 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  43.4 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03494  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0068  ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03446  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00212142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0102  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000949516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4983  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3846  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.05688e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4138  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  35.48 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0074  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000990162  hitchhiker  0.000000134659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3972  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000229702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4062  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000394805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5007  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000024574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2583  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  hitchhiker  0.000206552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4008  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4054  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3927  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0253871  hitchhiker  0.00124431 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4115  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4841  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000224524  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  40.32 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  40.32 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  41.38 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0179  ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1706  ribosomal protein L28  40 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298702  normal  0.0538671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  46.34 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2290  50S ribosomal protein L28P  40.68 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.798347 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  38.98 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2556  50S ribosomal protein L28  45 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00654  50S ribosomal protein L28  40.32 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001820  LSU ribosomal protein L28p  40.32 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  40.62 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4247  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 62 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3596  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0360  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3769  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326629  normal  0.774565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0378  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000507603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0463  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000843852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0377  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0918  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 99 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0389  50S ribosomal protein L28  37.1 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000230782  hitchhiker  0.0000579861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>