296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1602 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 62 aa  123  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  72.58 
 
 		 63 aa  98.2  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  73.77 
 
 		 62 aa  97.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 63 aa  97.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 63 aa  97.4  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  73.33 
 
 		 64 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  73.33 
 
 		 64 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  71.67 
 
 		 64 aa  92  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  58.06 
 
 		 63 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  50.88 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  49.21 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  52.54 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  50.88 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0905  ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000028073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  50.85 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2515  50S ribosomal protein L28  52.54 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  50.82 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  51.67 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2640  ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3424  50S ribosomal protein L28  54.24 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0875436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3180  50S ribosomal protein L28  49.21 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  51.67 
 
 		 66 aa  60.1  0.000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1253  50S ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0726  50S ribosomal protein L28  50.85 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140106  normal  0.323515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2016  50S ribosomal protein L28  50.85 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3114  50S ribosomal protein L28  50.85 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.878513  hitchhiker  0.00268781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1452  50S ribosomal protein L28  48.39 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0325  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0089  ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0224  50S ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3679  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185253  normal  0.0401063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3274  ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0370278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5537  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0793752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4374  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.335186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3567  ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5282  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5333  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220339 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5192  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244386  normal  0.27276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2425  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 69 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00488373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48050  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1706  ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298702  normal  0.0538671 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1734  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2445  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2323  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837544 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2713  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2583  50S ribosomal protein L28  50.85 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  hitchhiker  0.000206552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  45 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3302  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592148  normal  0.0516815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0601  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.201453  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2705  50S ribosomal protein L28  50.85 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.148445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2611  50S ribosomal protein L28  50.85 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0055  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378886  normal  0.0544728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0629  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000303775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>