279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0770 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  100 
 
 		 63 aa  124  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  77.42 
 
 		 63 aa  96.3  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  74.19 
 
 		 63 aa  93.6  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 63 aa  92  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  68.33 
 
 		 62 aa  89  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  69.35 
 
 		 64 aa  88.6  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  65 
 
 		 64 aa  84.3  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  65 
 
 		 64 aa  84.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  65 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  58.06 
 
 		 62 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  55.56 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4983  50S ribosomal protein L28  54.1 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3567  ribosomal protein L28  50.82 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2583  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  hitchhiker  0.000206552 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  51.61 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3667  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.817393  hitchhiker  0.00205217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4518  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1253  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0918  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  50 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0544  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.708685  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3302  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592148  normal  0.0516815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4559  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2016  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0726  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140106  normal  0.323515 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0905  ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000028073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3114  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.878513  hitchhiker  0.00268781 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2196  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472947  normal  0.335453 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0601  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.201453  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2445  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2713  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2323  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2702  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.645172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3105  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00824796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  35.59 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2015  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  45 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2556  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  35.59 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2339  ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2750  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1846  50S ribosomal protein L28  38.6 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3879  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0687874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>