275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3957 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  100 
 
 
62 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  98.39 
 
 
62 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  98.39 
 
 
62 aa  121  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  98.39 
 
 
62 aa  120  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 
62 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 
62 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  66.13 
 
 
62 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 
62 aa  87  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  70.69 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  68.97 
 
 
61 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  69.35 
 
 
62 aa  84.3  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  63.64 
 
 
61 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  55.36 
 
 
61 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  57.14 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  61.02 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  47.54 
 
 
71 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  49.18 
 
 
63 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  54.84 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  53.23 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  51.72 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  49.18 
 
 
63 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  45.9 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  45.61 
 
 
62 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  50 
 
 
64 aa  60.1  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  45.76 
 
 
62 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  49.15 
 
 
63 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 
62 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  45.16 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  45.76 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  42.37 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  43.55 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3785  ribosomal protein L28  40 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  47.54 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 
63 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 
63 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  40.32 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  48.28 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  40.32 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2515  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 
73 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  37.7 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0670  ribosomal protein L28  39.34 
 
 
62 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000425645  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 
62 aa  52  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  48.28 
 
 
79 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  37.7 
 
 
63 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  37.7 
 
 
63 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  40.98 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4841  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000224524  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  43.55 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  36.84 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  50 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1599  ribosomal protein L28  39.34 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118931  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  43.55 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0648  50S ribosomal protein L28P  56.1 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0290  ribosomal protein L28  42.86 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0206  ribosomal protein L28  40.98 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0315  ribosomal protein L28  40.32 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0997058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  44.07 
 
 
62 aa  50.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2786  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 
61 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408357  normal  0.0710246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  39.34 
 
 
63 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  37.7 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  40.35 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4560  50S ribosomal protein L28  51.16 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191213  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8002  LSU ribosomal protein L28P  37.7 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  38.71 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  38.6 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3846  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.05688e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4054  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0102  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000949516  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0074  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000990162  hitchhiker  0.000000134659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4138  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3972  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000229702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>