61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3785 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3785  ribosomal protein L28  100 
 
 		 76 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1189  50S ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  41.33 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  41.33 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  38.67 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  38.67 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  41.33 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  38.36 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3015  ribosomal protein L28  43.14 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0354  50S ribosomal protein L28  42.25 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00270118  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  39.47 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2480  50S ribosomal protein L28  43.14 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1351  ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000031136  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  37.68 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0071  ribosomal protein L28  54.05 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2279  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05560  LSU ribosomal protein L28P  32.89 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  34.78 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  34.78 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  38.67 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1384  50S ribosomal protein L28  29.33 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.626686  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0361  50S ribosomal protein L28  47.06 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  30.67 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1846  50S ribosomal protein L28  32 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  34.78 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1024  ribosomal protein L28  42.31 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  36.23 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  36.23 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3105  50S ribosomal protein L28  41.51 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00824796 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2250  ribosomal protein L28  39.22 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0446551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  32.86 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1027  50S ribosomal protein L28  33.8 
 
 		 70 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3287  50S ribosomal protein L28P  38.67 
 
 		 61 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0886721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0905  ribosomal protein L28  30.26 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000028073  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2425  50S ribosomal protein L28  32 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00488373  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  35.53 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0535  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  46.94 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  36 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  36 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2786  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408357  normal  0.0710246 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  33.33 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  31.58 
 
 		 62 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>