16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2250 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2250  ribosomal protein L28  100 
 
 		 71 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0446551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2480  50S ribosomal protein L28  57.81 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3015  ribosomal protein L28  54.69 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0535  50S ribosomal protein L28  56.94 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  47.83 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2279  ribosomal protein L28  46.38 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  33.33 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3785  ribosomal protein L28  39.22 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  41.43 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4672  ribosomal protein L28  34.78 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  34.78 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0991  ribosomal protein L28  37.68 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000939773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  30.43 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  30.43 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  36.23 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>