109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10080 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  100 
 
 		 76 aa  147  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  43.42 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2250  ribosomal protein L28  47.83 
 
 		 71 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0446551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3015  ribosomal protein L28  53.12 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3785  ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0670  ribosomal protein L28  47.44 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000425645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  44 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  41.33 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  45.07 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  44 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2480  50S ribosomal protein L28  52.38 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1705  50S ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  45.95 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1987  50S ribosomal protein L28  45.33 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4672  ribosomal protein L28  40.54 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  42.67 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2279  ribosomal protein L28  40.54 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  38.16 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  38.16 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  37.84 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  45.07 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  38.67 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  41.33 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2281  ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.921868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  41.33 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2515  50S ribosomal protein L28  40.28 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0991  ribosomal protein L28  43.24 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000939773  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  43.84 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8027  50S ribosomal protein L28  35.9 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  39.44 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  37.84 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11200  LSU ribosomal protein L28P  37.84 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00741345  normal  0.589072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1367  50S ribosomal protein L28  35.06 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.23268  normal  0.35924 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  43.42 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0354  50S ribosomal protein L28  43.66 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00270118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3439  ribosomal protein L28  36.49 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1599  ribosomal protein L28  36 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  37.33 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  36.49 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  40.79 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2611  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2705  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.148445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  39.73 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  49.06 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0645  50S ribosomal protein L28  40.54 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  43.94 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1189  50S ribosomal protein L28  41.03 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  38.67 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8002  LSU ribosomal protein L28P  36.49 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3608  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  37.14 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  34.67 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  36.62 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  35.14 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3287  50S ribosomal protein L28P  40.79 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0886721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2153  50S ribosomal protein L28  37.97 
 
 		 64 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.757041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4214  50S ribosomal protein L28  37.97 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0535  50S ribosomal protein L28  40.58 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  59.46 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1582  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.169175  normal  0.0677157 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  33.78 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1934  50S ribosomal protein L28  36.71 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1980  50S ribosomal protein L28  36.71 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1914  50S ribosomal protein L28  36.71 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.244589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1027  50S ribosomal protein L28  38.03 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1131  50S ribosomal protein L28  37.33 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0206  ribosomal protein L28  36.49 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05560  LSU ribosomal protein L28P  38.16 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2786  50S ribosomal protein L28  36.49 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408357  normal  0.0710246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12990  50S ribosomal protein L28  35 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.400597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2112  50S ribosomal protein L28  39.24 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.239307  normal  0.0348844 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0905  ribosomal protein L28  38.16 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000028073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  36 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  36 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1277  50S ribosomal protein L28  34.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.726545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1167  50S ribosomal protein L28  34.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422025  unclonable  0.0000000208051 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  45.24 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  45.24 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4037  ribosomal protein L28  34.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2835  ribosomal protein L28  34.62 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00627595  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  39.62 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1024  ribosomal protein L28  39.19 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5979  ribosomal protein L28  34.62 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0315  ribosomal protein L28  32.43 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0997058 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1351  ribosomal protein L28  33.77 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000031136  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1870  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.252757  hitchhiker  0.00588786 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0071  ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 63 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10800  LSU ribosomal protein L28P  33.77 
 
 		 64 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.53049  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  31.08 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  31.08 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  31.08 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>