223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0354 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0354  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 92 aa  180  6e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00270118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  45.78 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  42.17 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1189  50S ribosomal protein L28  45.78 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4983  50S ribosomal protein L28  39.76 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3567  ribosomal protein L28  43.37 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0918  50S ribosomal protein L28  43.18 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  39.51 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0648  50S ribosomal protein L28P  44.58 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1960  50S ribosomal protein L28  42.53 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2015  50S ribosomal protein L28  40.91 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.375117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  42.17 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  43.21 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  43.21 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  43.21 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  44.05 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3667  50S ribosomal protein L28  44.05 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.817393  hitchhiker  0.00205217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  43.21 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0601  ribosomal protein L28  36.96 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000015913  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  41.98 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  41.98 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0283  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  44.05 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0494  50S ribosomal protein L28  40.48 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3904  ribosomal protein L28  37.08 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000260959  normal  0.15188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2713  50S ribosomal protein L28  41.98 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2445  50S ribosomal protein L28  41.98 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2323  50S ribosomal protein L28  41.98 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3521  ribosomal protein L28  39.08 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0361  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4518  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1939  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0546  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0527039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  41.98 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1734  50S ribosomal protein L28  39.51 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1452  50S ribosomal protein L28  39.51 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36500  LSU ribosomal protein L28P  34.62 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1706  ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298702  normal  0.0538671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0543  50S ribosomal protein L28  40.48 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3087  ribosomal protein L28  41.46 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280967  normal  0.0287054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4559  ribosomal protein L28  37.35 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1710  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0395  50S ribosomal protein L28  36.14 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.249784  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3802  50S ribosomal protein L28  38.27 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1989  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0546  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  28.92 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1790  50S ribosomal protein L28  36.14 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.588702  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0481  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2339  ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3291  ribosomal protein L28  29.63 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  39.51 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1995  ribosomal protein L28  36.05 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0325  ribosomal protein L28  38.27 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2196  50S ribosomal protein L28  40.48 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472947  normal  0.335453 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0406  50S ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.624837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  38.27 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0077  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2556  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7548  50S ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0502  50S ribosomal protein L28  38.1 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2583  50S ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  hitchhiker  0.000206552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0753  50S ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.542713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  38.27 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2326  50S ribosomal protein L28  37.08 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.972077  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09591  50S ribosomal protein L28  36.26 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0503954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3856  ribosomal protein L28  30.12 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000509188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1117  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1253  50S ribosomal protein L28  37.04 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2750  50S ribosomal protein L28  40.48 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  43.66 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4041  50S ribosomal protein L28  40.48 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0589  50S ribosomal protein L28  35.8 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.74438  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0544  50S ribosomal protein L28  34.94 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0520  50S ribosomal protein L28  34.94 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0898  50S ribosomal protein L28  35.16 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.512107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>