219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0072 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  100 
 
 		 64 aa  130  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  54.1 
 
 		 63 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  49.21 
 
 		 63 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1705  50S ribosomal protein L28  46.03 
 
 		 63 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1987  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  49.21 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2323  50S ribosomal protein L28  50.79 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.28928e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  50.88 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1027  50S ribosomal protein L28  56.36 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  49.21 
 
 		 63 aa  66.6  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  50.88 
 
 		 62 aa  67  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  49.21 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  47.46 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0315  ribosomal protein L28  50.88 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0997058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  46.03 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  49.18 
 
 		 62 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3439  ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  46.03 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  45.61 
 
 		 63 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1518  ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0991  ribosomal protein L28  46.03 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000939773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  50 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2282  50S ribosomal protein L28  48.44 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  48.33 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2281  ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.921868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0072  ribosomal protein L28  47.62 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  46.03 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  39.68 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2397  50S ribosomal protein L28  46.03 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8027  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1279  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0423459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1351  ribosomal protein L28  50 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000031136  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2425  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00488373  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05560  LSU ribosomal protein L28P  48.28 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  39.68 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1846  50S ribosomal protein L28  46.88 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1384  50S ribosomal protein L28  45.31 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.626686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11200  LSU ribosomal protein L28P  38.1 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00741345  normal  0.589072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 63 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1024  ribosomal protein L28  47.27 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1367  50S ribosomal protein L28  40.98 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.23268  normal  0.35924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0670  ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000425645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  34.92 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3202  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3105  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00824796 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0905  ribosomal protein L28  43.75 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000028073  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1599  ribosomal protein L28  41.27 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4214  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  35 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2835  ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00627595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1582  50S ribosomal protein L28  40.32 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.169175  normal  0.0677157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2153  50S ribosomal protein L28  41.27 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.757041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2611  50S ribosomal protein L28  36.07 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2705  50S ribosomal protein L28  36.07 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.148445  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4037  ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1870  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.252757  hitchhiker  0.00588786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12990  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.400597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2515  50S ribosomal protein L28  34.43 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  44.83 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3274  ribosomal protein L28  39.68 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0370278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1934  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1167  50S ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422025  unclonable  0.0000000208051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1980  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1914  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.244589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1277  50S ribosomal protein L28  43.55 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.726545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5979  ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3659  ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1262  50S ribosomal protein L28  41.51 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000202821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3608  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0290  ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8002  LSU ribosomal protein L28P  40.98 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1045  ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000342446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10800  LSU ribosomal protein L28P  40 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.53049  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  37.14 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  36.84 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0071  ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>