197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3659 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3659  ribosomal protein L28  100 
 
 		 87 aa  176  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0290  ribosomal protein L28  79.31 
 
 		 87 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  51.85 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3639  50S ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000267113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  51.79 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  45.45 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8027  50S ribosomal protein L28  48.15 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0315  ribosomal protein L28  50 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0997058 
 
 
-
 
NC_002936  DET1262  50S ribosomal protein L28  40.38 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000202821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  42.86 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1073  50S ribosomal protein L28  44.23 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000450707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  43.86 
 
 		 62 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2199  ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 62 aa  52  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000434288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1367  50S ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.23268  normal  0.35924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3439  ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1351  ribosomal protein L28  52.63 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000031136  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1045  ribosomal protein L28  40.38 
 
 		 62 aa  50.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000342446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  46.15 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  43.64 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0206  ribosomal protein L28  49.09 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2281  ribosomal protein L28  48.15 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.921868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4214  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.220896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  42.59 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  38.89 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05560  LSU ribosomal protein L28P  50.88 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1934  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  44.64 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1980  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2153  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.757041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1914  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.244589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1277  50S ribosomal protein L28  46.43 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.726545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1167  50S ribosomal protein L28  46.43 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422025  unclonable  0.0000000208051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  42.59 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  40.74 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1744  50S ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000205787  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  43.08 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5979  ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 63 aa  48.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1833  ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000322971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3856  ribosomal protein L28  41.27 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000509188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3202  ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  43.08 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4518  50S ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0253871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1605  50S ribosomal protein L28  41.54 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1468  ribosomal protein L28  41.82 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0693  50S ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000218766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1312  ribosomal protein L28  39.19 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3667  50S ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.817393  hitchhiker  0.00205217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0669  50S ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000239992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11200  LSU ribosomal protein L28P  44.44 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00741345  normal  0.589072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1870  50S ribosomal protein L28  46.43 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.252757  hitchhiker  0.00588786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5489  50S ribosomal protein L28  45.45 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234709  normal  0.110528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1676  ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000538501  hitchhiker  0.00422618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2306  ribosomal protein L28  42.59 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000277359  hitchhiker  0.00207431 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0645  50S ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2835  ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00627595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1582  50S ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.169175  normal  0.0677157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0615  50S ribosomal protein L28  41.79 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.149975  normal  0.298778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4037  ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1918  ribosomal protein L28  39.44 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0165  50S ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1995  ribosomal protein L28  38.46 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.8198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8002  LSU ribosomal protein L28P  47.27 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.317284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09220  LSU ribosomal protein L28P  44.64 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0555993  normal  0.483187 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1508  50S ribosomal protein L28  46.3 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  48.21 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12990  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.400597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  48.21 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  39.29 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0991  ribosomal protein L28  35.19 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000939773  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0391  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2853  ribosomal protein L28  44.62 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3274  ribosomal protein L28  45.28 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0370278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1599  ribosomal protein L28  44.44 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0629  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000303775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3701  50S ribosomal protein L28  46.43 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3291  ribosomal protein L28  41.27 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2786  50S ribosomal protein L28  43.64 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408357  normal  0.0710246 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  42.86 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0821  ribosomal protein L28  41.51 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3608  50S ribosomal protein L28  44.64 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2641  50S ribosomal protein L28P  41.54 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>