176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1189 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1189  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0354  50S ribosomal protein L28  45.78 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00270118  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0361  50S ribosomal protein L28  43.42 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0610  ribosomal protein L28  44.29 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.904571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3785  ribosomal protein L28  48.57 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3567  ribosomal protein L28  35.71 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.663609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3087  ribosomal protein L28  34.52 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.280967  normal  0.0287054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3951  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3149  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.65679 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2589  50S ribosomal protein L28  30.95 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.155889 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03240  ribosomal protein L28  41.54 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0048  ribosomal protein L28  34.52 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.635259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0601  ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000015913  unclonable  0.00000708114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36500  LSU ribosomal protein L28P  38.16 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.608 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0395  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.249784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1790  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.588702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3428  50S ribosomal protein L28  29.76 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0550772  normal  0.711167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5365  50S ribosomal protein L28  29.76 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5537  50S ribosomal protein L28  35.53 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0793752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1743  50S ribosomal protein L28  37.66 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  41.03 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0570  hypothetical protein  30.12 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  31.58 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00055  ribosomal protein L28  34.52 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000288614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3904  ribosomal protein L28  51.92 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000260959  normal  0.15188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2231  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1137  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5834  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.685508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2139  ribosomal protein L28  29.76 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.476497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0780  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1891  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2549  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2502  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.553249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0582  50S ribosomal protein L28  35.53 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3384  50S ribosomal protein L28  29.76 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.237994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1757  50S ribosomal protein L28  31.58 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.991694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2420  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127484  hitchhiker  0.000900978 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1021  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0978  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0983  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2722  50S ribosomal protein L28  29.76 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.238973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0188  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0793  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0584  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3521  ribosomal protein L28  32.22 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3372  50S ribosomal protein L28  29.89 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2021  ribosomal protein L28  30.95 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2527  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3143  50S ribosomal protein L28  30.26 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00769008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1282  50S ribosomal protein L28  31.58 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2647  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2100  50S ribosomal protein L28  28.57 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.295795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4374  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.335186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5282  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001820  LSU ribosomal protein L28p  35.8 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0042  50S ribosomal protein L28  32.56 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0312  50S ribosomal protein L28  31.58 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000118312  normal  0.224841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5333  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3214  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48050  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5192  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244386  normal  0.27276 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00654  50S ribosomal protein L28  35.8 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2670  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0327  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0383291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70190  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0707  50S ribosomal protein L28  38.96 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6092  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0055  ribosomal protein L28  31.03 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378886  normal  0.0544728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  32.18 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0544  50S ribosomal protein L28  29.76 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0520  50S ribosomal protein L28  29.76 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1918  ribosomal protein L28  30.95 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0601  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.201453  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0089  ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0224  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0546  50S ribosomal protein L28  31.58 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3827  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.199336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2314  ribosomal protein L28  30.26 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.959649  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0481  50S ribosomal protein L28  31.58 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2599  50S ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0389  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000230782  hitchhiker  0.0000579861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0403  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109188  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4247  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0629  50S ribosomal protein L28  36.36 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.865933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3596  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0360  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3769  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326629  normal  0.774565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3565  50S ribosomal protein L28  32.89 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0150151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0378  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000507603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0191  50S ribosomal protein L28  35.53 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000089275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0463  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000843852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0377  50S ribosomal protein L28  34.21 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0544  50S ribosomal protein L28  31.58 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.708685  normal  0.742505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3927  50S ribosomal protein L28  32.14 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0253871  hitchhiker  0.00124431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>