9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0535 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0535  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2250  ribosomal protein L28  56.94 
 
 		 71 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0446551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3015  ribosomal protein L28  60.42 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2480  50S ribosomal protein L28  40.48 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  45.21 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  40.58 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0354  50S ribosomal protein L28  43.24 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00270118  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2279  ribosomal protein L28  48.94 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3785  ribosomal protein L28  33.33 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>