109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf005 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  100 
 
 		 65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl227  50S ribosomal protein L28  59.38 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0488  50S ribosomal protein L28  60 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0521885  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  55.38 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  52.46 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  48.33 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  48.33 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  48.33 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  46.67 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  57.45 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0021  ribosomal protein L28  50 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  53.19 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  49.12 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  53.19 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  52.83 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  50.91 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  48.33 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  48.33 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03494  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0068  ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138765  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  49.09 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  49.09 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0102  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000949516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  46.77 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3846  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.05688e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4138  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0074  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000990162  hitchhiker  0.000000134659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3972  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000229702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4062  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000394805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5007  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000024574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03446  hypothetical protein  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00212142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2139  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0181781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4841  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000224524  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4008  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4054  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3927  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0253871  hitchhiker  0.00124431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4115  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  49.09 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4983  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  53.19 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4559  ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1960  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  51.06 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  65.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0179  ribosomal protein L28  40 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  45.1 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0770  ribosomal protein L28  38.33 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0722  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1345  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  48.94 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13563  ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  46.81 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0327  ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0383291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145  50S ribosomal protein L28  42.62 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00227555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3827  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.199336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3836  50S ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000849102  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0544  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0520  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001820  LSU ribosomal protein L28p  42.37 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3480  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000307468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00654  50S ribosomal protein L28  42.37 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0386  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00127683  hitchhiker  0.000000115642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4247  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3596  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0360  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3769  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326629  normal  0.774565 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0378  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000507603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0463  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000843852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2599  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0377  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0389  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000230782  hitchhiker  0.0000579861 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4560  50S ribosomal protein L28  43.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191213  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0191  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000089275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0403  50S ribosomal protein L28  44.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109188  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0209  ribosomal protein L28  45 
 
 		 78 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0648  50S ribosomal protein L28P  44.26 
 
 		 80 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 79 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  39.58 
 
 		 63 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  41.38 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00055  ribosomal protein L28  40.68 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000288614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  40 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3565  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0150151  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2290  50S ribosomal protein L28P  42.86 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.798347 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2295  50S ribosomal protein L28  41.67 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0544676 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>