28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3758 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3758  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 168 aa  337  5.9999999999999996e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0698  TRAP dicarboxylate transporter- DctQ subunit  74.4 
 
 		 168 aa  241  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1042  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  34.52 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00385479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  29.08 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4737  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.03 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1090  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.11 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0890905  normal  0.431557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1470  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  21.95 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.355581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3955  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.38 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.948597  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0195  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.37 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224778  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3156  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.8 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2862  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.01 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.779712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.03 
 
 		 241 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.48 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3328  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.36 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2238  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.85 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0893  hypothetical protein  22.5 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000529967  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0961  tripartite ATP-independent periplasmic transporter, DctQ component  22.22 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.093725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1870  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30 
 
 		 164 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3002  TRAP transporter - DctQ subunit  22.12 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1387  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.21 
 
 		 241 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5035  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  27.78 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0449  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.99 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1662  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.21 
 
 		 241 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  0.892075 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3318  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.85 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00300706  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003133  TRAP dicarboxylate transporter DctQ subunit  22.01 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00512706  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  32.14 
 
 		 193 aa  40.8  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.56 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455407  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.57 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>