26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2465 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2465  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
288 aa  552  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.642092  normal  0.482268 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1340  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  56.16 
 
 
278 aa  265  1e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  48.42 
 
 
264 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  35.14 
 
 
1148 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.85 
 
 
1094 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.25 
 
 
1343 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.82 
 
 
546 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.45 
 
 
1224 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.77 
 
 
958 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  35.4 
 
 
319 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
1041 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  35.62 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.93 
 
 
157 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
399 aa  45.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.82 
 
 
150 aa  45.8  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.69 
 
 
831 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  35.25 
 
 
374 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.96 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.17 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.61 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.45 
 
 
666 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.43 
 
 
192 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3584  HEAT domain containing protein  32.58 
 
 
375 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.755925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3712  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.21 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13018  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.79 
 
 
313 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>