22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1708 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1708  integrase family protein  100 
 
 		 195 aa  396  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0471  integrase family protein  41.33 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.73175  normal  0.809938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0251  integrase family protein  41.62 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3600  integrase family protein  39.55 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 302 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.35 
 
 		 598 aa  50.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.26 
 
 		 369 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.58 
 
 		 369 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  29.7 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  27.88 
 
 		 286 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  26.79 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  23.63 
 
 		 329 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  24.83 
 
 		 341 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.75 
 
 		 454 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 376 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  25.5 
 
 		 335 aa  43.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.83 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.96 
 
 		 369 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  26.12 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  31.01 
 
 		 361 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  27.91 
 
 		 291 aa  41.6  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>