29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0471 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0471  integrase family protein  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.73175  normal  0.809938 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1708  integrase family protein  41.33 
 
 		 195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0251  integrase family protein  42.13 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3600  integrase family protein  41.94 
 
 		 201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3266  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 330 aa  52.8  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119927  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.12 
 
 		 598 aa  50.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  22.63 
 
 		 369 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.63 
 
 		 369 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  30.5 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  30.5 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  30.5 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  22.92 
 
 		 369 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1273  phage integrase  27.22 
 
 		 331 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  25.62 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  28.42 
 
 		 369 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.97 
 
 		 386 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  25.56 
 
 		 387 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 387 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  25.56 
 
 		 387 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0421  integrase family protein  31.13 
 
 		 329 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  29.58 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  29.95 
 
 		 387 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 329 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.44 
 
 		 390 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  26.6 
 
 		 387 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  28.57 
 
 		 324 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  23.76 
 
 		 348 aa  41.6  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  28.4 
 
 		 737 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>