32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1440 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  299  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6519  hypothetical protein  34.52 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139993  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924144  normal  0.0155035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4468  hypothetical protein  34.67 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0853749 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3153  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000729071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393467  normal  0.0155499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  31.4 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0306  hypothetical protein  31.18 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  31.96 
 
 		 243 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3396  hypothetical protein  31.18 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2843  hypothetical protein  31.18 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2242  hypothetical protein  31.18 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0094  hypothetical protein  31.18 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2265  XRE family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000780415  unclonable  0.00000217866 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0108  hypothetical protein  31.18 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.554325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1511  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  37.31 
 
 		 217 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3234  hypothetical protein  31.18 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3985  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  30.56 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  33.77 
 
 		 222 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  27.88 
 
 		 131 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  37.21 
 
 		 235 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4467  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3097  hypothetical protein  30.95 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  35.82 
 
 		 218 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1650  hypothetical protein  30.09 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0344  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000026589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3246  hypothetical protein  32.47 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>